| Глава от книга |
|
1
|
Dimitrios Kaloudas, Nikolet Pavlova, Robert Penchovsky, Computational Design of Allosteric Ribozymes via Genetic Algorithms, RNA Amplification and Analysis. Methods in Molecular Biology, vol 2822. , ISBN:978-1-0716-3917-7, Springer, New York, Ref, Рецензирано, International
|
2024
|
|
2
|
Robert Penchovsky, Georgi Miloshev, Nikolet Pavlova, Katya Popova, Lozena Otcheva, Aikaterini Valsamatzi, Martina Traykovska, Book: New Frontiers and Applications of Synthetic Biology; chapter 8. Small RNA-based systems for sensing and therapeutic applications
, ISBN:9780128244692, Elsevier, Ref, Рецензирано, International
|
2022
|
|
3
|
Dimitrios Kaloudas, Robert Penchovsky, book: Research Anthology on Recent Advancements in Ethnopharmacology and Nutraceuticals, chapter: Plant-Derived Compounds and Their Potential Role in Drug Development, ISBN:9781668435465, IGI Global , USA, Ref, Рецензирано, International
|
2022
|
|
4
|
Aikaterini Valsamatzi-Panagiotou, Katya B. Popova, Robert Penchovsky, Drug Discovery for Targeting Drug Resistant Bacteria, ISBN:978-3-030-53024-2, Springer, USA, Ref, International
|
2021
|
|
5
|
Aikaterini Valsamatzi-Panagiotou, Katya B. Popova, Robert Penchovsky, Sustainable Agriculture Reviews 49 Mitigation of Antimicrobial Resistance Vol. 2, Natural and Synthetic Approaches, Chapter 1: "Strategies for prevention and containment of antimicrobial resistance"., ISSN (print):978-3-030-58258-6, ISBN:978-3-030-58258-6, Springer, Ref, International
|
2021
|
|
6
|
Aikaterini Valsamatzi-Panagiotou, Martina Traykovska, Robert Penchovsky, Mechanisms of antibacterial drug resistance and approaches to overcome, ISBN:B978-0-12-818480-6.00002-3, Drug Discovery Targeting Drug-Resistant Bacteria, Ref, Рецензирано
|
2020
|
|
7
|
Aikaterini Valsamatzi-Panagiotou, Katya B. Popova, Robert Penchovsky, Sustainable Agriculture Reviews 46
Mitigation of Antimicrobial Resistance Vol. 1, Tools and Targets: Chapter 9: "Drug Discovery for Targeting Drug Resistant Bacteria"., ISSN (print):978-3-030-53023-5, ISBN:978-3-030-53023-5, Springer, Ref, International
|
2020
|
|
8
|
Aikaterini Valsamatzi-Panagiotou, Martina Traykovska, Robert Penchovsky, Mechanisms of Drug resistance and Approaches to overcome it , Elsevier, Ref, Рецензирано
|
2019
|
|
9
|
Robert Penchovsky, Nucleic acids-based nanotechnology. Biomedical Engineering: Concepts, Methodologies, Tools, and Applications, IGI-Global, Ref, Рецензирано
|
2017
|
|
10
|
Robert Penchovsky, Martina Traykovska, Synthetic Approaches to Biology: engineering gene control circuits, synthesizing, and editing genomes, Emerging Research on Bioinspired Materials Engineering, ISSN (online):, IGI Global, Ref, Рецензирано
|
2016
|
|
11
|
Robert Penchovsky, Bioinformatics: Concepts, Methodologies, Tools, and Applications:Engineering Gene Control Circuits with Allosteric Ribozymes in Human Cells as a Medicine of the Future, ISBN: 9781466636040, IGI-Global, USA, Ref
|
2013
|
| Дипломна работа |
|
1
|
Роберт Димитров Пенчовски, Компютърен анализ на генетични текстове, Свободен факултет, Софийски Университет
|
1995
|
|
2
|
Роберт Димитров Пенчовски, Експресия на протоонкогените DFRA и DJRA при туморната супресорна мутация l(2)gd, БФ, СУ
|
1994
|
| Дисертация д-р |
|
|
Роберт Димитров Пенчовски, An Integrated DNA Selection in Micro-flow Reactors as an Approach for Molecular Computation and Diagnostics, Cologne University, Germany, Ръководител:проф. Джонатан Хаурд
|
2003
|
| Книга |
|
1
|
Robert Penchovsky, An Integrated DNA Selection in Micro-flow Reactors as an Approach for Molecular Computation and Diagnostics, ISBN:978-619-91360-0-3, Ref, Рецензирано
|
2019
|
|
2
|
Robert Penchovsky, Nucleic Acids-Based Nanotechnology: Engineering Principals and Applications, ISBN:978-1-5225-3158-6
|
2018
|
|
3
|
Robert Penchovsky, Handbook of Research on Nanoscience,
Nanotechnology, and Advanced Materials
, ISBN:146665824X, Engineering science reference: An Imprint of IGI Global , Ref, Рецензирано
|
2014
|
|
4
|
Robert Penchovsky, Penchovsky, Robert, Nucleic Acids-Based Nanotechnology: Engineering Principals and Applications, ISSN (print):978-1-4666-5824-0, ISBN:978-1-4666-5824-0
|
2014
|
|
5
|
Robert Penchovsky, Engineering Gene Control Circuits with Allosteric Ribozymes in Human Cells as a Medicine of the Future, ISBN:978-1-4666-3604-0
|
2013
|
| Монография |
|
1
|
Martina Traykovska, Robert Penchovsky, Дизайн на антисенс олигонуклеотиди и приложението им като антибактериални агенти: принципи, механизми на действие и предизвикателства, ISBN:978-954-07-6132-9, Университетско издателство „Св. Климент Охридски“, София, Рецензирано
|
2025
|
|
2
|
Robert Penchovsky, Quality
Assurance in Healthcare Service Delivery, Nursing and Personalized
Medicine: Technologies and Processes.
Engineering Gene Control Circuits with Allosteric
Ribozymes in Human Cells as a Medicine of the Future, Publisher IGI Global: DOI: 10.4018/978-1-120-7, Рецензирано
|
2012
|
| Научен проект |
|
1
|
Роберт Пенчовски, Създаване на софтуерни системи за компютърен дизайн на бързи алостерични рибозими, които усещат присъствието на олигонуклеотиди с точно дефинирана секвенция и база данни за клинично значими генетични вариации при човека за кандидатстване за два патента, Ръководител, SUMMIT, Номер на договора:№70-123-194/ 12.02.2024 по № BG-RRP-2.004-0008 SUMMIT
|
2024
|
|
2
|
Роберт Пенчовски, Дизайн на антисенс олигoнуклеотиди свързани с клетъчно проникващи олигопептиди като нови антибактериални агенти срещу резистентни патогенни бактерии при човека за кандидатстване за европейски патент, Ръководител, SUMMIT, Номер на договора:4011
|
2023
|
|
3
|
Роберт Пенчовски, Сравнителен анализ на ефективността на нови антибактериални агенти базирани на различни видове антисенс олигонуклеотиди с използване на различни молекулни механизми на РНК инхибиране, Ръководител, МОН - ФОНД "НАУЧНИ ИЗСЛЕДВАНИЯ"
|
2022
|
|
4
|
Роберт Пенчовски, Антисенс олигонуклеотиди, които специфично се свързват с рибопревклячвателя за тиамин пирофосфат при човешки паточенни бактерии, Ръководител, ФНИ_СУ, Номер на договора:80-10-31/18.03.2020
|
2020
|
|
5
|
Роберт Пенчовски, Прилагане на антисенс олигонуклеотиди като антибктериални агенти срещу Enterococcus faecalis, Ръководител, МОН - Млади учени и постдокторанти, Номер на договора:РД-22-838/2020
|
2020
|
|
6
|
Роберт Пенчовски, Антисенс олигокуклеотиди, които специфично се свързват с ФМН рибопревключвател при човешки патогенни бактерии, Ръководител, ФНИ_СУ, Номер на договора:80-10-45/10.04.2019
|
2019
|
|
7
|
Роберт Пенчовски, Дизайн на функционални нуклеинови киселини за синтетична регулация на генна експресия при прокариоти и еукариоти, Ръководител, ФНИ МОН, Номер на договора:КП-06-Н31/18/13.12.2019
|
2019
|
|
8
|
Роберт Пенчовски, Прилагане на антисенсолигонуклеотиди като антибактериални агенти при Staphylococcus aureus, Член, ФНИ_СУ, Номер на договора:РД-22-1032
|
2019
|
|
9
|
Роберт Пенчовски, Нови методи за създаване на антибактериални агенти срещу
Listeria Monocytogenes, чрез използване на антисенс олигонуклеотиди, Ръководител, ФНИ_СУ
|
2018
|
|
10
|
Роберт Пенчовски, Центъра за компетентност „Чисти технологии за устойчива околна среда – води, отпадъци, енергия за кръгова икономика“, Член, Европейски Съюз и МОН
|
2018
|
|
11
|
Роберт Пенчовски, Дизайн и експериментално тестване на химерни антисенс олигонуклеотиди като антибактериални агенти, Ръководител, ФНИ МОН, Номер на договора:ДН/13/14/20.12.2017
|
2017
|
|
12
|
Роберт Пенчовски, Докторантски център "Св. Климент Охридски" (ДокЦент), Член, Европейски Съюз и МОН, Номер на договора:BG05M2OP001-2.009.0013
|
2017
|
|
13
|
Роберт Пенчовски, Изграждане и развитие на млади висококвалифицирани изследователи и преподаватели за иновативни интердисциплинарни изследвания от полза за биомедицината, Член, Европейски Съюз и МОН, Номер на договора:BG05M2OP001-2.009-0019-С01/02.06.2017
|
2017
|
|
14
|
Роберт Пенчовски, Нови методи за създаване на антибиотици срещу резистентни щамове на Escherichia coli, чрез използване на антисенс олигонуклеотиди, които инхибират биохимични пътища, контролирани от рибопревключватели, Ръководител, ФНИ на СУ, Номер на договора:80-10-100/20.04.2017
|
2017
|
|
15
|
Роберт Пенчовски, Нови методи за откриване на антибиотични агенти срещу резистентни щамове на Staphylococcus aureus чрез прилагане на антисенс олигонуклеотиди, Ръководител, ФНИ на СУ, Номер на договора:179/ 13.04.2016
|
2016
|
|
16
|
Роберт Пенчовски, Студентски практики – Фаза 1, Член, Европейски съюз и МОН, Номер на договора:BG05M20P001-2.002-0001
|
2016
|
|
17
|
Роберт Пенчовски, Приложение на антисенс олигонуклеотиди за специфично инхибиране на бактериални РНКи, като нов метод за създаване на антибиотици, Ръководител, ФНИ_СУ, Номер на договора:12/27.03.2015
|
2015
|
|
18
|
Роберт Пенчовски, “ДИЗАЙН И ПРИЛОЖЕНИЯ НА РНК БИОСЕНЗОРИ ИН ВИТРО И ИН ВИВО”, Ръководител, ФНИ МОН, Номер на договора:ДДВУ02/5/2010
|
2010
|
|
19
|
Роберт Пенчовски, Exogenous Control of Gene Expression by Designer Ribozymes, Член, National Institute of Health (NIH), USA, Номер на договора:N01-HV-28186
|
2004
|
|
20
|
Роберт Пенчовски, Molecular Computation by Allosteric Ribozymes, Член, Defense Advanced Research Projects Agency (DARPA), USA
|
2003
|
|
21
|
Роберт Пенчовски, DNACom –Configurable DNA Computing, Член, BMBF, Germany, Номер на договора:01SF9952
|
1999
|
| Научно ръководство |
|
1
|
Роберт Пенчовски, Дизайн и приложение на функционални нуклеинови киселини за синтетичен контрол на генна експресия, Биологическия факултет, Софийски Унижерситет дисертация д-р:Георги Йорданов Милошев
|
2023
|
|
2
|
Роберт Пенчовски, Дизайн и експериментално тестване на химерни антисенс олигонуклеотиди като антибактериални агенти, дисертация д-р:Лозена Адриянова Отчева
|
2021
|
|
3
|
Роберт Пенчовски, ДИЗАЙН И ПРИЛОЖЕНИЯ НА ФУНКЦИОНАЛНИ НУКЛЕИНОВИ КИСЕЛИНИ ЗА КОНТРОЛ НА ГЕННА ЕКСПРЕСИЯ И СЪЗДАВАНЕ НА НОВИ ТЕРАПЕВТИЧНИ АГЕНТИ, дисертация д-р:Катя Бисерова Попова ДИЗАЙН
|
2021
|
|
4
|
Роберт Пенчовски, ДИЗАЙН НА ХИМЕРНИ АНТИСЕНС ОЛИГОНУКЛЕОТИДИ И НАЧАЛНА ОЦЕНКА НА ТЯХНОТО ИЗПОЛЗВАНЕ ЗА ТЕРАПЕВТИЧНИ ЦЕЛИ, дисертация д-р:Екатерини Валсаматзи-Панайоту
|
2021
|
|
5
|
Роберт Пенчовски, Биоинформатичен и геномен анализ на рибопревключватели и свързани с тях биохомични пътища при човешки патогенни бактерии и използването им като мишени за създаване на нови антибактериални агенти, дисертация д-р:Николет Илиева Павлова
|
2019
|
|
6
|
Роберт Пенчовски, Сравнителен биоинформатичен анализ на рибопревключватели при мезофилни и термофилни бактерии, дипломна работа:Методи Синадинов
|
2019
|
|
7
|
Роберт Пенчовски, Биоинформатичен и геномен анализ на експресията на РНК молекули при меланома и рак на черния дроб, дипломна работа:Георги Иванов Ковачев
|
2017
|
|
8
|
Роберт Пенчовски, Биоинформатичен и геномен анализ на експресията на РНК молекули при рак на белите дробове и рак на простатата, дипломна работа:Николай Тодоров Тодоров
|
2017
|
|
9
|
Роберт Пенчовски, Дизайн и създаване на биоинформатичен уев сървър/Design and Creation of a Bioinformatics Web server, Биологическия факултет дипломна работа:Димитриос Калудас
|
2017
|
|
10
|
Роберт Пенчовски, Инженерство на функционални нуклеинови киселини и приложението им в областите на Молекулярната генетика и Синтетичната биология, дисертация д-р:Мартина Трайковска
|
2017
|
|
11
|
Герит Беемстер и Роберт Пенчовски, Функционален анализ на мутанти къса листа в царевица, Биологическия факултет дипломна работа:Дена Пановска
|
2017
|
|
12
|
Роберт Пенчовски, Bioinformatics and Genomics Analyses of the Riboswitches for TPP, Purine, SAM-I, SAH and Their Related Biochemical Pathways in Human Pathogenic Bacteria for Antibacterial Drug Discovery, дипломна работа:Kristina Ragaliauskaite
|
2016
|
|
13
|
Роберт Пенчовски, Биоинформатичен и геномен анализ на рибопревключвателите за FMN, GlmS, Cobalamin и Lysine и свързаните с тях биохимични пътища при човешки патогенни бактерии като мишени за създаване на нови антибиотици, дипломна работа:Николет Павлова
|
2016
|
|
14
|
Роберт Пенчовски, ФИЛОГЕНЕТИЧ АНАЛИЗ НА ПОПУЛАЦИЯТА НА ГЪБАТА
PSEUDOGYMNOASCUS DESTRUCTANS, ПРИЧИНИТЕЛ НА БОЛЕСТТА НА БЕЛИЯ НОС ПРИ ПРИЛЕПИТЕ, В БАЛАБАНОВА ДУПКА, ЗАПАДНА СТАРА ПЛАНИНА, дипломна работа:Виолета Любомирова Желязкова
|
2016
|
|
15
|
Роберт Пенчовски, Компютърен дизайн и биохимично тестване на високо скоростни алостерични рибозими, които усещат присъствие на теофилин, дипломна работа:Теодора Димитрова Чуртова
|
2014
|
|
16
|
Роберт Пенчовски, Създаване на RT-PCR метод за количествено измерване присъствието на Carnobacterium maltaromatica при обработени скариди и употребата на Lactococcus piscium с цел тяхната консервация, дипломна работа:Мария Христова Попадийска
|
2014
|
|
17
|
Роберт Пенчовски, Универсален метод за инхибиране каталитичната функция на хамърхед рибозимата чрез хибридизация с пептид нуклеинов олигомер, дипломна работа:Мартина Трайковска
|
2014
|
|
18
|
Роберт Пенчовски, Bioinformatics Analyses of Bacterial Riboswitches, СУ, БФ дипломна работа:Исраа Мохамед Рият Хюсеин
|
2013
|
|
19
|
Роберт Пенчовски, Създаване на метод за терминация на транскрипцията in vitro за откриване на нови антибиотици, които специфично свързват рибофлавиновия превключвател, СУ, БФ дипломна работа:Цветелина Лъчезарова Манолова
|
2013
|
|
20
|
Роберт Пенчовски, Използване на рибопревключвателя за гуанин за създаване на биосензори за откриване на нови антибиотици, СУ, БФ дипломна работа:Цветелина Чавдарова Стоилова
|
2012
|
|
21
|
Роберт Пенчовски, Компютърен дизайн и биохимично характеризиране на алостерични рибозими за детекция на иРНК на гена tert, кодиращ теломеразна обратна трансриптаза при Homo sapiens, СУ, БФ дипломна работа:Гергана Цветанова Костова
|
2012
|
|
22
|
Роберт Пенчовски, Компютърен дизайн и биохимично характеризиране на алостерични рибозими за детекция на иРНК на гена acta2 кодиращ Алфа2 Актин в Mus Musculus, СУ, БФ дипломна работа:Димитър Тодоров Тодоров
|
2011
|
| Редактор на издание реферирано |
|
|
Роберт Пенчовски, Antibiotics, Редактор на издание реферирано
|
2022
|
| Статия в научно списание |
|
1
|
Robert Penchovsky, Antoniya V. Georgieva, Vanya Dyakova, Martina Traykovska, Nikolet Pavlova, Antisense and Functional Nucleic Acids in Rational Drug Development, Antibiotics , vol:13, issue:3, 2024, pages:221-243, ISSN (print):2079-6382, Ref, Web of Science, IF (4.8 - ), Web of Science Quartile: Q1 (2024), SCOPUS, SJR (5.5 - 2023), SCOPUS Quartile: Q1 (2024), PhD
|
2024
|
|
2
|
Katya B. Popova, Robert Penchovsky, General and Specific Cytotoxicity of Chimeric Antisense Oligonucleotides in Bacterial Cells and Human Cell Lines, Antibiotics , vol:13, issue:2, 2024, doi:https://doi.org/10.3390/antibiotics13020122, Ref, IR , SCOPUS, SJR (5.5 - 2023), SCOPUS Quartile: Q1 (2024), PhD
|
2024
|
|
3
|
Dimitrios Kaloudas, Nikolet Pavlova, Robert Penchovsky, GHOST-NOT and GHOST-YES: Two Programs for Generating high-speed Biosensors with Randomized Oligonucleotide Binding Sites with NOT or YES Boolean Logic Functions Based on Experimentally Validated Algorithms , Journal of Biotechnology, 2023, ISSN (print):0168-1656, doi:https://doi.org/10.1016/j.jbiotec.2023.07.005, Ref, SCOPUS, SJR (6.8 - 2023), SCOPUS Quartile: Q1 (2023), International
|
2023
|
|
4
|
Dimitrios Kaloudas, Robert Penchovsky, Molecular factors affecting tomato fruit size, Plant Gene, 2023, doi:10.1016/j.plgene.2022.100395, Ref, SCOPUS, SJR (3.2 - 2022), SCOPUS Quartile: Q2 (2023), International
|
2023
|
|
5
|
Nikolet Pavlova, Martina Traykovska, Robert Penchovsky, Targeting FMN, TPP, SAM-I, and glmS Riboswitches with Chimeric Antisense Oligonucleotides for Completely Rational Antibacterial Drug Development, Antibiotics , issue:issue 11, volume 12, 2023, pages:1-25, doi:10.3390/antibiotics12111607, Ref, Web of Science, IF (4.8 - 2023), Web of Science Quartile: Q1 (2023), SCOPUS, SJR (5.5 - ), SCOPUS Quartile: Q1 (2023)
|
2023
|
|
6
|
Aikaterini Valsamatzi-Panagiotou, Martina Traykovska, Georgie Miloshev, Robert Penchovsky, Various therapies against SARS-CoV-2, ACTA MICROBIOLOGICA BULGARICA, vol:39, issue:1, 2023, pages:3-11, ISSN (online):0204-8809, Ref, SCOPUS, SJR (0.154 - ), SCOPUS Quartile: Q4 (2023), PhD
|
2023
|
|
7
|
Dimitrios Kaloudas, Robert Penchovsky, An allosteric ribozyme generator and an inverse folding ribozyme generator: two computer programs for automated computational design of oligonucleotide-sensing allosteric hammerhead ribozymes with YES Boolean logic function based on experimentally validated algorithms, Computers in Biology and Medicine , 2022, ISSN (print):0010-4825, doi:10.1016/j.compbiomed.2022.105469, Ref, IR , SCOPUS, SJR (7.3 - 2020), SCOPUS Quartile: Q1 (2020), International
|
2022
|
|
8
|
Nikolet Pavlova, Robert Penchovsky, Bioinformatics and Genomic Analyses of the Suitability of Eight Riboswitches for Antibacterial Drug Targets, Antibiotics , vol:11, issue:9, 2022, doi:10.3390/antibiotics11091177, Ref, SCOPUS, SJR (5.5 - 2022), SCOPUS Quartile: Q1 (2022)
|
2022
|
|
9
|
Aikaterini Valsamatzi, Martina Traykovska, Robert Penchovsky, Coronavirus SARS-CoV-2: Where do we stand? , Acta Microbiologica Bulgarica, том:38, брой:4, 2022, ISSN (print):0204-8809, ISSN (online):2603-3755, Ref, IR , SCOPUS, SJR (0.154 - 2022), SCOPUS Quartile: Q4 (2022), в сътрудничество с чуждестранни учени
|
2022
|
|
10
|
Martina Traykovska, Robert Penchovsky, Engineering antisense oligonucleotides as antibacterial agents that target FMN riboswitches and inhibit the growth of Staphylococcus aureus, Listeria monocytogenes, and Escherichia coli, ACS Synthetic Biology, 2022, pages:1845-1855, ISSN (online):2161-5063, doi:10.1021/acssynbio.2c00013, Ref, IR , SCOPUS, SJR (5 - 2022), SCOPUS Quartile: Q1 (2022)
|
2022
|
|
11
|
Aikaterini Valsamatzi-Panagiotou, Robert Penchovsky, Environmental factors influencing the transmission of the coronavirus 2019: a review, Environmental Chemistry Letters, 2022, doi:10.1007/s10311-022-01418-9, Ref, IR , SCOPUS, SJR (9 - 2020), SCOPUS Quartile: Q1 (2022), International, PhD
|
2022
|
|
12
|
Martina Traykovska, Robert Penchovsky, Targeting SAM-I Riboswitch Using Antisense Oligonucleotide Technology for Inhibiting the Growth of Staphylococcus aureus and Listeria monocytogenes, Antibiotics , 2022, Ref, Web of Science, IF (5.5 - ), Web of Science Quartile: Q1 (2022), SCOPUS, SJR (5.2 - 2022), SCOPUS Quartile: Q1 (2022)
|
2022
|
|
13
|
Martina Traykovska, Lozena A. Otcheva, Robert Penchovsky, Targeting TPP riboswitches using chimeric antisense oligonucleotide technology for antibacterial drug development , ACS Applied Bio Materials, 2022, pages:4896-4902, ISSN (print):2576-6422, doi:10.1021/acsabm.2c00628, Ref, IF, IF (4.5 - ), Web of Science Quartile: Q1 (2022), SCOPUS Quartile: Q1 (2022), PhD
|
2022
|
|
14
|
Robert Penchovsky, Nikolet Pavlova, Antoniya V Georgieva, Georgi Miloshev, Martina Traykovska, Versatile Tools of Synthetic Biology Applied to Drug Discovery and Production, Future Medicinal Chemistry, 2022
|
2022
|
|
15
|
Pavlova, Nikolet, Miloshev, Georgi Y., Georgieva, Antoniya, V, Traykovska, Martina, Penchovsky, Robert, Versatile tools of synthetic biology applied to drug discovery and production, FUTURE MEDICINAL CHEMISTRY, vol:14, issue:18, 2022, pages:1325-1340, ISSN (print):1756-8919, ISSN (online):1756-8927, doi:10.4155/fmc-2022-0063
|
2022
|
|
16
|
Katya B Popova, Robert Penchovsky, Current Activators of the glmS Riboswitch, Biomedical Journal of Science and Technological Research , 2021, ISSN (online):2574 -1241, doi:10.26717/BJSTR.2021.33.005348, Ref, Web of Science, др., International, PhD
|
2021
|
|
17
|
Robert Penchovsky, Nikolet Pavlova, Dimitrios Kaloudas, ExBWS: Extended Bioinformatics Web Services for Sequence Analyses, International Journal of Bioinformatics Research and Applications, том:17, брой:4, 2021, стр.:291-302, ISSN (print):1744-5485, ISSN (online):1744-5493, doi:10.1504/IJBRA.2021.117928, Ref, IR , SCOPUS, SJR (0.8 - 2020), SCOPUS Quartile: Q4 (SCOPUS), PhD, MSc
|
2021
|
|
18
|
Dimitrios Kaloudas, Nikolet Pavlova, Robert Penchovsky, Lignocellulose, algal biomass, biofuels, and biohydrogen: a review, Environmental Chemistry Letters, 2021, ISSN (print):16103653, doi:10.1007/s10311-021-01213-y, Ref, IR , SCOPUS, SJR (9 - 2020), SCOPUS Quartile: Q1 (2021), International
|
2021
|
|
19
|
Valsamatzi-Panagiotou, Aikaterini, Popova, Katya B., Robert Penchovsky, Methods for prevention and constraint of antimicrobial resistance: a review, Environmental Chemistry Letters, 2021, ISSN (print):16103653, doi:10.1007/s10311-021-01206-x, Ref, IR , SCOPUS, SJR (9 - 2020), SCOPUS Quartile: Q1 (2021)
|
2021
|
|
20
|
Katya B Popova, Aikaterini Valsamatzi-Panagiotou, Robert Penchovsky, New drug discovery strategies for targeting drug-resistant bacteria, Environmental Chemistry Letters, 2021, ISSN (print):16103653, doi:10.1007/s10311-021-01181-3, Ref, IR , SCOPUS, SJR (9 - 2021), SCOPUS Quartile: Q1 (2020), International, PhD
|
2021
|
|
21
|
Dimitrios Kaloudas, Nikolet Pavlova, Robert Penchovsky, Phycoremediation of wastewater by microalgae: a review, Environmental Chemistry Letters, 2021, doi:10.1007/s10311-021-01203-0, Ref, IR , SCOPUS, SJR (9 - 2022), SCOPUS Quartile: Q1 (2021), International
|
2021
|
|
22
|
Robert Penchovsky, Nikolet Pavlova, Dimitrios Kaloudas, RSwitch: a novel bioinformatics database on riboswitches as antibacterial drug targets, IEEE Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, vol:18, issue:2, 2021, pages:804-808, ISSN (print):1545-5963 , ISSN (online):1557-9964, doi:10.1109/TCBB.2020.2983922, Ref, IF, IF (2.8 - 2020), Web of Science Quartile: Q1 (WEB OF SCIENCE), International, PhD
|
2021
|
|
23
|
Martina Traykovska, Katya B. Popova, Robert Penchovsky, Targeting glmS Ribozyme with Chimeric Antisense Oligonucleotides
for Antibacterial Drug Development, ACS Synthetic Biology, 2021, pages:3167-3176, doi:https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acssynbio.1c00443, Ref, Web of Science, IF (5.5 - ), Web of Science Quartile: Q1 (2021), SCOPUS, SJR (5.5 - 2021), SCOPUS Quartile: Q1 (2021), PhD
|
2021
|
|
24
|
Katya B Popova, Robert Penchovsky, Why Some Functional RNAs Such as Bacterial Riboswitches are Versatile Targets for Antibacterial Drug Discovery?, EC Microbiology, vol:16, issue:11, 2020, Ref, др., PhD
|
2020
|
|
25
|
Lozena A Otcheva, Nikolet Pavlova, Katya B Popova, Martina Traykovska, Robert Penchovsky, Why some Riboswitches are Suitable Targets for Antibacterial Drug Discovery, EC Microbiology, vol:16, issue:11, 2020, pages:48-51, Ref, IF (1.73 - ), др., PhD
|
2020
|
|
26
|
Robert Penchovsky, Automated DNA hybridization transfer with movable super-paramagnetic microbeads in a microflow reactor, Biosensors and Bioelectronics , брой:135, 2019, стр.:30-35, ISSN (print):0956-5663, doi:https://doi.org/10.1016/j.bios.2019.04.014, Ref, Web of Science, SCOPUS Quartile: Q1 (SCOPUS)
|
2019
|
|
27
|
Robert Penchovsky, Kaloudas, Dimitrios, Pavlova, Nikolet, Penchovsky, Robert, EBWS: Essential Bioinformatics Web Services for Sequence Analyses, IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, vol:16, issue:3, 2019, pages:942-953, ISSN (print):1545-5963, ISSN (online):1557-9964, doi:10.1109/TCBB.2018.2816645
|
2019
|
|
28
|
Nikolet Pavlova, Robert Penchovsky, Genome-wide bioinformatics analysis of FMN, SAM-I, glmS, TPP, Lysine, Purine, Cobalamin, and SAH riboswitches for their applications as allosteric antibacterial drug targets in human pathogenic bacteria, Expert Opinion on Therapeutic Targets , 2019, doi:10.1080/14728222.2019.1618274, Ref, Web of Science, SCOPUS Quartile: Q1 (SCOPUS), PhD
|
2019
|
|
29
|
Wisnewski, Adam V, Liu, Jian, Robert Penchovsky, LC-UV-MS and MS/MS Characterize Glutathione Reactivity with Different Isomers (2,2' and 2,4' vs. 4,4') of Methylene Diphenyl-Diisocyanate., EC pharmacology and toxicology, vol:7, issue:3, 2019, pages:205-219
|
2019
|
|
30
|
Nikolet Pavlova, Dimitrios Kaloudas, Robert Penchovsky, Riboswitch distribution, structure, and function in bacteria, Gene, 2019, ISSN (print):0378-1119, doi:https://doi.org/10.1016/j.gene.2019.05.036, Ref, Web of Science, SCOPUS Quartile: Q1 (SCOPUS), в сътрудничество с чуждестранни учени, PhD
|
2019
|
|
31
|
Dimitrios Kaloudas, Robert Penchovsky, Arabidopsis Homologues to the LRAT a Possible Substrate for New Plant-Based Anti-Cancer Drug Development, International Journal of Biomedical and Clinical Engineering (IJBCE), том:7, брой:1, 2018, стр.:40-52, ISSN (online): 2161-1610, doi:10.4018/IJBCE.2018010103, Ref, в сътрудничество с чуждестранни учени, MSc
|
2018
|
|
32
|
Martina Traykovska, Sjoerd Miedema, Robert Penchovsky, Clinical Trials of Functional Nucleic Acids: Antisense Oligonucleotides and Aptamers, International Journal of Biomedical and Clinical Engineering (IJBCI), vol:7, issue:2, 2018, pages:46-60, ISSN (online):2161-1610, doi:10.4018/IJBCE.2018070104, Ref, MSc
|
2018
|
|
33
|
Dimitrios Kaloudas, Nikolet Pavlova, Robert Penchovsky, EBWS: Essential Bioinformatics Web Services for Sequence Analyses, IEEE Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, том:99, 2018, ISSN (print):1545-5963, ISSN (online):1557-9964, doi:10.1109/TCBB.2018.2816645, Ref, Web of Science, SCOPUS Quartile: Q1 (Web of Science), в сътрудничество с чуждестранни учени, PhD, MSc
|
2018
|
|
34
|
Dimitrios Kaloudas, Robert Penchovsky, Plant-Derived Compounds and Their Potential Role in Drug Development, nternational Journal of Biomedical and Clinical Engineering (IJBCE), том:7, брой:1, 2018, стр.:53-66, ISBN:2161-1610, doi:10.4018/IJBCE.2018010104, Ref, в сътрудничество с чуждестранни учени, MSc
|
2018
|
|
35
|
Katya B Popova, Lozena A Otcheva, Martina Traykovska, Robert Penchovsky, RNA as A Potent Target for Antibacterial Drug Discovery, Biomedical Journal of Scientific and Technical Research , vol:10, issue:2, 2018, ISSN (online):2574-1241, doi:10.26717/BJSTR.2018.10.001938 , Ref, Web of Science, др., PhD
|
2018
|
|
36
|
Robert Penchovsky, Martina Traykovska, Designing drugs that overcome antibacterial resistance: where do we stand and what should we do?, Expert opinion on drug discovery, том:10, брой:6, 2015, стр.:631-650, ISSN (print):1746-0441, doi:10.1517/17460441.2015.1048219, Ref, Web of Science, SCOPUS Quartile: Q1 (SCOPUS), PhD
|
2015
|
|
37
|
Robert Penchovsky, Computational Design of Allosteric Ribozymes as Molecular Biosensors , Biotechnology Advances, брой:3, 2014, стр.:1015-1027, doi:10.1016/j.biotechadv.2014.05.005, Ref, Web of Science, SCOPUS Quartile: Q1 (SCOPUS)
|
2014
|
|
38
|
Robert Penchovsky, Computational design and biosensor applications of small molecule-sensing allosteric ribozymes, Biomacromolecules, том:14, брой:4, 2013, стр.:1240-1249, ISSN (print):1525-7797, ISSN (online):1526-4602, doi:10.1021/bm400299a., Ref, Web of Science, SCOPUS Quartile: Q1 (SCOPUS)
|
2013
|
|
39
|
Robert Penchovsky, Gergana T. Kostova, Computational selection and experimental validation of allosteric ribozymes that sense a specific sequence of human telomerase reverse transcriptase mRNAs as universal anticancer therapy agents., Nucleic Acid Ther, том:23, брой:6, 2013, стр.:408-417, doi:10.1089/nat.2013.0446, Ref, Web of Science, MSc
|
2013
|
|
40
|
Robert Penchovsky, Martina Traykovska, Engineering Microfluidic and Nucleic acid-based Biosensoring Devices with versatile applications to modern biotechnology, International Conference Kliment's Days, 2013, стр.:23-24
|
2013
|
|
41
|
Robert Penchovsky, Present and Future RNA-based Approaches to Medical Genomics, Journal of Clinical & Medical Genomics, 2013, ISSN (online):2472-128X, doi:10.4172/2332-0672.1000110, Ref, Web of Science, SCOPUS Quartile: Q4 (WEB OF SCIENCE)
|
2013
|
|
42
|
Robert Penchovsky, Programmable and automated bead-based microfluidics for versatile DNA microarrays under isothermal conditions, Lab on a chip, брой:13, 2013, стр.:2370-2380, ISBN:14730197, doi:10.1039/C3LC50208B, Ref, Web of Science, SCOPUS Quartile: Q1 (SCOPUS)
|
2013
|
|
43
|
Robert Penchovsky, Cvetelina C. Stoilova, Riboswitch-based antibacterial drug discovery using high-throughput screening methods, Expert Opinion on Drug Discovery, том:8, брой:1, 2013, стр.:65-82, ISSN (print):1746-0441, doi:10.1517/17460441.2013.740455, Ref, Web of Science, SCOPUS Quartile: Q1 (SCOPUS), MSc
|
2013
|
|
44
|
Robert Penchovsky, Engineering integrated digital circuits with allosteric ribozymes for scaling up molecular computation and diagnostics., ACS Synth Biol, том:1, брой:10, 2012, стр.:471-482, ISBN:21615063, doi:10.1021/sb300053s, Ref, Web of Science, SCOPUS Quartile: Q1 (SCOPUS)
|
2012
|
|
45
|
Blount, K., Puskarz, I., Robert Penchovsky, Breaker, R.R., Development and
application of a high-throughput assay for glmS Riboswitch Activators, RNA Biol, том:3, брой:2, 2006, стр.:77-81, ISBN:15558584, doi:10.4161/rna.3.2.3102, Ref, Web of Science, SCOPUS Quartile: Q1 (SCOPUS)
|
2006
|
|
46
|
Robert Penchovsky, Breaker, R.R., Computational design and
experimental validation of oligonucleotide-sensing allosteric ribozymes, Nature Biotechnology, том:23, брой:11, 2005, стр.:1424-1433, ISBN:10870156, doi:10.1038/nbt1155 , Ref, Web of Science, SCOPUS Quartile: Q1 (SCOPUS)
|
2005
|
|
47
|
Robert Penchovsky, Ackermann, J, DNA library design for molecular computation, J Comput Biol, том:10, брой:2, 2003, стр.:215-229, ISBN:10665277, doi:10.1089/106652703321825973, Ref, Web of Science, SCOPUS Quartile: Q1 (SCOPUS)
|
2003
|
|
48
|
Robert Penchovsky, Birch-Hirschfeld, E., McCaskill, J.S., End-specific covalent photo-dependent immobilisation of synthetic DNA to paramagnetic beads., Nucleic Acids Res., том:28, брой:22, 2000, стр.:1-10, ISBN:1362-4962, doi:10.1093/nar/28.22.e98, Ref, Web of Science, SCOPUS Quartile: Q1 (SCOPUS)
|
2000
|
|
49
|
Robert Penchovsky, Relle, M., Rücker, T, McCaskill, J.S., Programmieren mit Molekülen., Der GMD-Spiegel, vol:3, 1999, pages:17-19
|
1999
|
|
50
|
Robert Penchovsky, Chakarov S.,, Genova G., The tumor suppressor
mutation l(2)gd in D. melanogaster elevates the binding activity of the transcription factors AP-1, Comptes redus de I’Academie bulgare des Sciences, том:51, 1998, стр.:83-86, ISSN (print): 1310–1331, ISSN (online):2367–5535, Ref, IR , SCOPUS, SJR (0.206 - 2015), SCOPUS Quartile: Q4 (SCOPUS)
|
1998
|
| Статия в поредица |
|
1
|
Robert Penchovsky, McCaskill, J.S.,, Cascadable hybridisation transfer of
specific DNA between microreactor selection modules, Lecture Notes in Computer Sciences, брой:2340, 2002, стр.:46-56, ISBN:03029743, doi:10.1007/3-540-48017-X_5, Ref, Web of Science, SCOPUS Quartile: Q2 (SCOPUS)
|
2002
|
|
2
|
McCaskill, J.S., Robert Penchovsky, Steady flow micro-reactor module for pipelined DNA computations, Lecture Notes in Computer Sciences, брой:2054, 2001, стр.:263-270, ISBN:03029743, doi:10.1007/3-540-44992-2_18 , Ref, Web of Science, SCOPUS Quartile: Q1 (SCOPUS)
|
2001
|
| Статия в сборник (на конференция и др.) |
|
1
|
Georgi Y. Miloshev, Martina Traykovska, Dimitrios Kaloudas, Robert Penchovsky, ENGINEERING A PLASMID AS A REPORTER SYSTEMFOR QUANTIFYING GENE EXPRESSION IN ESCHERICHIA COLI, Proceedings of the Bulgarian Academy of Sciences, 2022, pages:56-61, Ref, IF (0.38 - ), SCOPUS, SJR (0.154 - ), SCOPUS Quartile: Q3 (2022), International, MSc
|
2022
|
|
2
|
Nikolet Pavlova, Robert Penchovsky, Bioinformatics Web-Based server for bacterial genome analysis , 14th Congress of Microbiologists in Bulgaria with International Participation, 2018, PhD
|
2018
|
|
3
|
Lozena A. Otcheva, Katya B. Popova, Nikolet Pavlova, Martina Traykovska, Robert Penchovsky, Control of gene expression by bacterial riboswitches and their application as drug targets, 14th Congress of Microbiologists in Bulgaria with International Participation, 2018, PhD
|
2018
|
|
4
|
Nikolet Pavlova, Dimitrios Kaloudas, Robert Penchovsky, Essential Bioinformatics Web Services for Sequence Analyses., German Conference on Bioinformatics , 2018, Ref, SCOPUS Quartile: Q4 (SCOPUS), в сътрудничество с чуждестранни учени, PhD
|
2018
|
|
5
|
Katya B. Popova, Lozena A. Otcheva, Martina Traykovska, Robert Penchovsky, Probing general toxicity of antisense oligonucleotides to bacterial and mammalian cells, 14th Congress of Microbiologists in Bulgaria with International Participation, 2018, PhD
|
2018
|
|
6
|
Robert Penchovsky, Computational Design of Allosteric ribozymes as Biosensors and Molecular Computing Devices, 125 години математика и природни науки в СУ, 2014, pages:177-178, ISSN (print):1313-9045, doi:10.1016/j.biotechadv.2014.05.005
|
2014
|
|
7
|
Robert Penchovsky, Engineering allosteric ribozymes and their application in the fields of synthetic biology and pharmaceutical biotechnology, Първа Национална Конференция по Биотехнология, 2014, стр.:27-28
|
2014
|
| Студия в научно списание |
|
|
Robert Penchovsky, Aikaterini Valsamatzi-Panagiotou, Engineering antisense oligonucleotides as antibacterial
agents, Archives of Clinical Microbiology, vol:10, 2019, ISSN (print):1989-8436, doi:10.4172/1989-8436-C1-017, Ref, Web of Science, SCOPUS Quartile: Q4 (2019), International, PhD
|
2019
|
| Участие в конференция |
|
1
|
Постер, Нилолет Павлова, Мартина Трайковска, Роберт Пенчовски, Design of antisense oligonucleotides linked with cell penetrating oligopeptides as new antibacterial agents against resistant human pathogenic bacteria
|
2025
|
|
2
|
Постер, Николет Павлова, Мартина Трайковска и Роберт Пенчовски, Creation of software systems for computer-aid design of rapid allosteric ribozymes that sense the presence of sequence-defined oligonucleotides and database...
|
2025
|
|
3
|
Пленарен доклад, Роберт Пенчовски, Как научихме рибозомите да казват „ДА“, „НЕ“, „ИЛИ“, „И“ и да изпълняват сложни логически операции?
|
2024
|
|
4
|
Пленарен доклад, Роберт Пенчовски, Антисенс и функционални нуклеинови киселини в рационалното разработване на лекарства
|
2024
|
|
5
|
Секционен доклад, Роберт Пенчовски, Targeting Riboswitches with Chimeric Antisense Oligonucleotides for Completely Rational Antibacterial Drug Development
|
2024
|
|
6
|
Пленарен доклад, Роберт Пенчовски, Новите антибиотици
|
2023
|
|
7
|
Пленарен доклад, Роберт Пенчовски и Мартина Трайковска, Targeting glmS and FMN riboswitches with antisense oligonucleotides for antibactеrial drug development
|
2022
|
|
8
|
Постер, Мартина Трайковска и Роберт Пенчовски, Прилагане на антисенс олигонуклеотиди като антибктериални агенти срещу Enterococcus faecalis
|
2021
|
|
9
|
Секционен доклад, Роберт Пенчовски, Дизайн и експериментално тестване на химерни антисенс олигонуклеотиди като антибактериални агенти - проект: ДН/13/14/20.12.2017
|
2019
|
|
10
|
Пленарен доклад, Роберт Пенчовски и Екатерини Валсамаци, Engineering antisense oligonucleotides as antibacterial agents
|
2019
|
|
11
|
Секционен доклад, Lozena A. Otcheva, Katya B. Popova, Nikolet Pavlova, Martina Traykovska, Robert Penchovsky , Control of gene expression by bacterial riboswitches and their
application as drug targets
|
2018
|
|
12
|
Пленарен доклад, Роберт Пенчовски, Design and application of antisense oligonucleotides as antibacterial agents
|
2018
|
|
13
|
Секционен доклад, Katya B. Popova, Lozena A. Otcheva, Martina Traykovska and Robert Penchovsky, Probing general toxicity of antisense oligonucleotides to bacterial
and mammalian cells
|
2018
|
|
14
|
Секционен доклад, Николет Павлова и Роберт Пенчовски, EBWS: Essential Bioinformatics Web Services for Sequence Analyses
|
2018
|
|
15
|
Секционен доклад, Николет Павлова, Роберт Пенчовски, Bioinformatics Web-Based server for bacterial genome analyses
|
2018
|
|
16
|
Секционен доклад, Роберт Пенчовски, Microfluidics and functional nucleic acids as tools in personalized medicine
|
2017
|
|
17
|
Секционен доклад, Роберт Пенчовски, Developing drugs that overcome antibacterial resistance: where do we stand and what should we do?
|
2017
|
|
18
|
Секционен доклад, Роберт Пенчовски, Engineering integrated digital circuits with allosteric ribozymes for scaling up molecular computation and diagnostics of rare diseases
|
2017
|
|
19
|
Секционен доклад, Роберт Пенчовски, Дизайн и приложения на функционални и антисенс нуклеинови киселини за разработването на нови лекарската
|
2016
|
|
20
|
Секционен доклад, Роберт Пенчовски, Bio-ethical problems in genetics
|
2015
|
|
21
|
Секционен доклад, Роберт Пенчовски, Engineering Allosteric ribozymes and their application in the fields of synthetic biology and pharmaceutical biotechnology
|
2014
|
|
22
|
Секционен доклад, Роберт Пенчовски, Computational Design of Alloteric Ribozymes as Biosensors and Molecular Computing Devices
|
2014
|
|
23
|
Секционен доклад, Роберт Пенчовски, Engineering Microfluidic and Nucleic acid-based Biosensoring Devices with versatile applications
|
2013
|
|
24
|
Секционен доклад, Роберт Пенчовски, Конструирани РНК и микрофлуидно базирани сензори като инструменти в медицинската геномика
|
2013
|
|
25
|
Секционен доклад, Роберт Пенчовски, Design and Screening of riboswitches and their applications as biosensors to exogenous control of gene expression, molecular computing and drug development
|
2010
|
|
26
|
Секционен доклад, Роберт Пенчовски, Computational Selection of Small Molecule-sensing Allosteric Ribozymes
|
2006
|
|
27
|
Секционен доклад, Роберт Пенчовски, Exogenous Control of Gene Expression in E. coli by allosteric ribozymes
|
2006
|
|
28
|
Секционен доклад, Роберт Пенчовски, Molecular Computing with Designer Ribozymes
|
2005
|
|
29
|
Секционен доклад, Роберт Пенчовски, Computational Design of Allosteric Ribozymes with Various Boolean Logic Functions
|
2005
|
|
30
|
Секционен доклад, Роберт Пенчовски, Computational Design of Allosteric Ribozymes
|
2005
|
|
31
|
Секционен доклад, Роберт Пенчовски, Sensing the Length of RNA Molecules by Designer Ribozymes
|
2005
|
|
32
|
Секционен доклад, Роберт Пенчовски, Computational Design of Oligonucleotide-sensing Allosteric Ribozymes
|
2004
|
|
33
|
Секционен доклад, Роберт Пенчовски, Cascade DNA hybridization transfer in microflow reactors
|
2001
|
|
34
|
Секционен доклад, Роберт Пенчовски, Microfluidics for Molecular Computation
|
2000
|
|
35
|
Секционен доклад, Роберт Пенчовски, Microfluidics for DNA-based Computation
|
2000
|
| Участие в редколегия |
|
1
|
Роберт Пенчовски, Frontiers in Synthetic Biology, Участие в редколегия
|
2022
|
|
2
|
Роберт Пенчовски, EC Microbiology (ECMI), Участие в редколегия
|
2018
|
|